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上村研出来事集
2022年の出来事
- 生命科学研究科附属生命動態研究センターの定例セミナーに、白髭克彦先生（東京大学 定量生命科学研究所/Karolinska Institutet）をお招きしました。まず、渡辺佳織さんが “Systemic and chromatin regulatory mechanisms controlling animal growth and reproduction on carbohydrate-rich diets” との演題で発表して、次に白髭先生が “Regulation of transcription elongation by Cohesin -Beyond loop extrusion and enhancer-promoter interaction” との演題でセミナーをして頂きました。圧倒的なセミナーをありがとうございました！(7/22)
- 荻田さんの学位公聴会が開催されました。同日午後に中川真一さん（北海道大学・大学院薬学研究院、学術変革領域（A）「非ドメイン型バイオポリマーの生物学」領域代表）がインフォーマルセミナーをして下さいました。濃密な１日でした。写真を上村研写真集に掲載しました。（7/19）
- 第23回生命科学研究科シンポジウムがハイブリッドフォーマットで開催され、碓井さん、服部さん、近藤さん、春本さんが発表しました。演題名は研究科HPにあるポスター でご覧いただけます。開催の準備と当日の進行にご尽力下さった片山高嶺先生、片山研究室の皆さま、生命科学研究科総務掛の皆さまに心から御礼申し上げます（7/7-8）。
- 修了生の下野 耕平さん（住友ファーマ株式会社）が訪ねてくださいました。写真を上村研写真集に掲載しました。（6/30）
- 近藤さんと服部さんが、学内で開催された【JST創発】融合の場に参加し発表しました。（6/13-14）
- 第55回日本発生生物学会大会が金沢で開催され、近藤さん、坂口さん、水野さんが参加しました。大会長の佐藤純先生と準備委員会の先生方、ご苦労様でした！（5/31-6/3）
- 荻田さんの論文 “Image-based parameter inference for epithelial mechanics” が PLOS Computational Biology に受理されました！おめでとうございます。近藤さんも共同研究者として参加しました。荻田さんは今月学位公聴会に臨みます。（5/31）
- 服部さんが、創発的研究支援事業の2022年度学内向け説明会で、採択者の経験談を話しました。（5/26）
- 近藤さんが、生命科学研究科のオンラインおよび対面での入試説明会計３回（2/5, 4/2, 5/14）で、生命動態教養研究施設・次世代シーケンス室の説明をして、その録画が Youtube と研究科HP上で公開されました。ご苦労様でした！
- 金岡さんの論文 “Inter-organ Wingless/Ror/Akt signaling regulates nutrient-dependent hyperarborization of somatosensory neurons” が bioRxiv で公開されました。渡辺さんや卒業生の小野寺さんとの共著です。学術雑誌でレビュー中です。（5/1）
- 服部さんが、新学術領域研究「クロマチン潜在能」の領域会議に出席して発表しました。（4/25-27）
- 丹羽隆介先生（筑波大学）との共同研究の論文 “Shortened lifespan induced by a high-glucose diet is associated with intestinal immune dysfunction in Drosophila sechellia” が Jxiv で公開されました。学術雑誌でレビュー中です。（4/22）
- 柳田充弘先生の傘寿をお祝いし、益々のご健康を祈念する「柳田生命科学シンポジウム」が、京都大学国際科学イノベーション棟シンポジウムホールで開催されました。柳田先生は、上村さんの恩師でいらしゃると共に、生命科学研究科創設時の基幹講座の教授であり、二代目の研究科長でもいらっしゃいます。柳田先生の研究室出身者が世界中から参加しました！上村さんはローカルオーガナイザーの一人を務め、今井さん、渡辺さん、水野さん、司君、田口さん、吉井君はお手伝いをしました。（4/2）
- 津山さんが成虫型脂肪組織の発生を調べた論文 “Dynamic de novo adipose tissue development during metamorphosis in Drosophila melanogaster ” が bioRxiv で公開されました。同じく卒業生の駒井さん、下野さん、そして在学生の林さんとの共著です。学術雑誌に direct transfer されてレビュー中です。（3/31）
- オンライン学会 “The International Symposium on Development and Plasticity of Neural Systems” で、碓井さんが口頭発表しました（3/16）。
- 卒業生の石東博 (SHI, Dongbo) さんが来訪され、植物園で上村さんと議論しました。２週間後にラボを構えるポツダム大学へ向けて出発とのことです。ご無事と新天地での活躍をお祈り申し上げます！写真を上村研写真集に掲載しました。（3/13）
- オンラインシンポジウム “Toward Understanding of the Mechanisms of Development, Metabolism, Aging, and Diseases using Drosophila and C. elegans: Outstanding researches in East Asia and Oceania”（筑波大学 TARA Center 丹羽隆介さん主催）に、多数のメンバが参加しました（3/3-4）。
- 生命科学研究科主催 Spring School が始まり、前田さん、本多君、黒須君の3名が上村研で実験を始めました（2/28）。Wellcome!
- 生命科学研究科として初めての試みであるオンライン入試説明会が開催されました。委員長の今吉先生、副委員長の中野先生、教務掛の皆さんらのご尽力のおかげです。ご苦労様でした！渡辺さんが修了生代表として、生命科学研究科での研究や大学院生活について素晴らしい紹介をしました。（2/5）
- 第５回KBMSS (Kyoto Biomolecular Mass Spectrometry Society、京都生体質量分析研究会) がオンライン開催され、上村さんらが出席しました。今回は工学研究科の先生方が主催されました。ありがとうございました。（1/28）
- 上村さんがオンライン開催された AMED 機能低下領域に出席して水谷さんの研究を発表しました。（1/25-26）
- 新学術領域「クロマチン潜在能」国際シンポジウム “The 30th Hot Spring Harbor International Symposium” に服部さんが招待され、渡辺さんと進めている研究を発表しました。（1/18-19）
2021年の出来事
- クリスマス会を兼ねたプチ忘年会をオンラインで開催しました。皆さん、今年一年ご苦労様でした。2022年もよろしくお願いします。（12/24）
- 荻田さん（東京大学杉村薫研究室で研究中）が日本生物物理学会「メカノバイオ討論会2021」でポスター発表し、学生発表賞を受賞しました！多数の皆さまが議論に来てくださいました。（12/13）
- 上村さんが淡路夢舞台で開催された新学術領域「発生時計と場の連携」班会議に参加して、 渡辺さんと服部さんの研究について口頭発表しました。領域代表の影山龍一郎先生と皆さまに大変お世話になりました。ありがとうございました！(12/9-11)
- 荻田さん（東京大学杉村薫研究室で研究中）が The 51st NIPS International Symposium “Frontiers in Epithelial Cell Biology” でポスター発表しました。タイトルは “Image-based statistical inference of mechanical parameters governing epithelial morphogenesis” です。（12/6-8）
- MBSJ2021（第44回日本日本分子生物学会＠横浜）に、多数のメンバーが参加しました。研究室メンバーにとって１年半以上のブランクの後での待望の対面開催の学会でした。服部さんが中川真一さん（北大・薬）とオーガナイザーを務めたワークショップ「種の個性を生み出す原動力とは何か?」は満員御礼でした。そこで渡辺さんが発表しました。服部さんはワークショップ「宿主-共生細菌環境をデザインする 新時代に向けて」で牟禮さんと進めている研究を発表しました。牟禮さんはオンラインで、坂口さん（近藤グループ）、林さん、司さんは現地でポスター発表をしました。さらに金岡さんと水谷さんはオンラインで、近藤さんと上村さんは現地で参加しました。年会長を務められた塩見美喜子先生（東京大学）と関係者の皆様に厚く御礼申し上げます。写真を上村研写真集に掲載しました。（12/1-3）
- 有志がカールトン研の皆さんと一緒に、お昼に真如堂への散策を楽しみました。紅葉を見ながら楽しい時間を過ごすことができました。写真を上村研写真集に掲載しました。（11/26）
- 荻田さん（東京大学杉村薫研究室で研究中）が第59回日本生物物理学会年会で英語で口頭発表しました。タイトルは「画像データから上皮細胞の力学パラメータを推定する手法の開発」です。（11/25-27）
- 上村さんが EMBO|EMBL Symposium “Metabolism Meets Epigenetics” に参加して、 水谷さんの研究について口頭発表しました。（11/17-21）
- オンライン開催された “Neurogenetics of the Drosophila larva 2021” に、多数のメンバーが参加しました。碓井さんが Kai さん＋司さんの研究を、上村さんが金岡さんの研究を発表して、それぞれたくさんの質問やコメントを頂きました。オーガナイザーを務められた Dan Tracey さん (Indiana University Bloomington) らに厚く感謝申し上げます。Tracey さんの演題 “The #Seabattical expedition of 2019: jumping larvae of the Caribbean” ではサイエンスの楽しさを満喫しました。（10/17-21）
- JDRC14（第14回日本ショウジョウバエ研究集会）オンラインに、研究室メンバーこぞって参加しました。坪井さんと坂口さん（近藤グループ）、そして金岡さんが受賞しました！他のメンバーも、口頭あるいはポスター発表に、座長あるいは審査員として活躍しました。会長を務められた丹羽隆介先生（筑波大学）と研究室の皆様に厚く御礼申し上げます。丹羽先生から受賞者への記念品贈呈の写真と、受賞内容の詳細を上村研写真集に掲載しました。（9/13-16）
- 卒研生全員が生命科学研究科の大学院入試に合格しました！（8/25）
- 石川冬木先生の研究室のご出身で現在堀川高校の教員をなさっている片山雄一郎先生のご紹介で、自然科学部所属のお二人が来訪されました。教員との記念撮影を上村研写真集に掲載しました。（8/10）
- 2017年に Wild & Wise Program のメンバーとして短期滞在した Yi-Shan CHIEN イ・サンが来訪してくれました。日本国内の企業に就職後、京大で仕事をした足で寄ってくれました。ピカチュウ大好きのイ・サンとの再会の写真を上村研写真集に掲載しました。（7/29）
- 第22回生命科学研究科シンポジウムがハイブリッドフォーマットで開催され、上村さんが発表しました。演題名は “Impacts of nutrition histories in juvenile stages on growth and longevity（幼若期の栄養履歴が個体成長と寿命に与える影響）” でした。開催の準備と当日の進行にご尽力下さった原田浩先生、原田研究室の皆さま、生命科学研究科総務掛の皆さまに心から御礼申し上げます（7/1-2）。
- 第54回日本発生生物学会オンライン大会に、上村さん、服部さん、近藤さん、渡辺さん、金岡さんが参加しました。金岡さんはポスター発表を行いました。年会長を務められた中川真一先生をはじめ、大会の運営に携わった皆様に御礼申し上げます (6/17-18)。
- 坂口さんと大河内康之さん（本田研）が共同した研究の論文が、Nature Communications から出版されました！タイトルは "Model-based prediction of spatial gene expression via generative linear mapping" です (6/17)。
- 服部さんが新学術領域「クロマチン潜在能」の領域会議で公募班員として発表しました（5/24）。
- 近藤さんと服部さんがそれぞれ、JST 創発的研究支援事業の第 1 回「創発の場」で発表しました（5/13）。
- ５月の連休前に大そうじと新人歓迎会（オンライン）をしました（4/26-28）。
- 生命科学研究科若手研究者を対象とするワークショップが開催され、上村さんと服部さんが研究費採択の経験談を話しました。開催の準備と当日の司会にご尽力下さった学術研究支援室 (KURA) の皆様と、分子情報解析学分野の粂田昌宏先生にお礼申し上げます（4/22）。
- メンバーを更新しました。新人が５名加わりました！今井さん（補佐員）、水野さん（D1）、田口さん、栗生さん、吉井さん（以上４回生）です。昨年度途中から春本グループに参加している倉又さんもメンバーに記載しました（4/1）
- 沖さんの送別会をオンラインで開催しました（3/30）。上村研究室の「幹部」の一人として盤石の仕事ぶりを示されてきた沖かなえさんが、学内の他部局で京都大学事務職員としてお勤めを始められます。おめでとうございます！スクリーンショットを上村研写真集に掲載しました。
- 理学部・理学研究科をご退官になる沼田英治先生が来訪下さいました。大変印象深い最終講義（3月12日）を聴講しました。今後もぜひご指導賜りたいです！メンバーとの記念撮影を上村研写真集に掲載しました。(3/30)
- 上村さんが Keystone eSymposia “Metabolic Decisions in Development and Disease” で招待講演者の一人として発表しました。演題は “Impacts of Nutrition Histories in Juvenile Stages on Growth and Later Life Events” でした。渡辺さん、金岡さん、水谷さん、牟禮さんも参加しました（3/24-26）。
- 妻鳥さんの送別会かつ荻田さんと羅さんの壮行会をオンラインで開催しました（3/15）。スクリーンショットを上村研写真集に掲載しました。妻鳥さんは修士課程を修了して就職され、荻田さんと羅さんは杉村薫准教授（東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻）の研究室で研究を開始します。皆さんの新天地での活躍を祈ってます！
- 近藤さんと服部さんの研究提案が、それぞれ、JST の創発的研究支援事業・2020年度採択課題に選ばれました！（2/2）
- 上村さん、渡辺さん、服部さんが執筆した総説「モデル生物と非モデル生物との対比で迫る栄養環境への適応機構」が、「生化学」の特集「食・栄養から健康を拓く生化学」に掲載されました（2/24）。
- 水野苑子さん（横浜市立大学大学院修士課程出身）が、大学院生命科学研究科博士後期課程編入学試験に合格しました。４月から加わる多数のルーキーの一人になります！（2/23）
- 生命動態研究センターのオンラインリトリートが開催され、近藤グループの坪井さんが口頭発表しました。多数の質問がありました。林さんはポスター発表をしました。（1/23）
2020年の出来事
- 水野苑子さん（横浜市立大学大学院修士課程出身）が研究室を訪問してくれました（12/21）。大学院時代の研究内容を発表してもらって皆で議論しました。
- 渡辺佳織さんが第37回井上研究奨励賞（2020年度）を受賞しました！渡辺さん、おめでとうございます！ 審査の労をお執り下さいました井上科学振興財団の先生方に厚く御礼申し上げます。(12/14）
- サテライトシンポジウム ISFRCB（クロマチン生物学分野の女性研究者の国際シンポジウム）2020 がオンライン開催されました。渡辺さんがセッション2で発表しました。上村さんがセッション3で発表し、そしてパネリストとして参加しました。300人が参加登録され、常時100人以上の視聴する盛会となりました。オーガナイザーの皆さん、ご苦労様でした！(12/5)
- MBSJ2020 Online の最終日では、近藤さんがワークショップで発表しました。年会長を務めた上村さんは、Developmental Cell 誌の Editor でいらっしゃる Spyros Goulas さんをお迎えして年会長企画フォーラムを開催しました。Spyros さんの熱弁に心打たれました。写真を上村研写真集に掲載しました。3日間の会期を通じてのべ 12,000人近い皆さまに参加頂きました！参加下さった皆さま、開催にご協力賜った皆さま、ありがとうございました！(12/4)
- 第43回日本分子生物学会年会 MBSJ2020 Online の第2日目では、服部さんがシンポジウムで発表し、坪井さんと司さんがポスター発表しました。上村さんは総会で年会の開催状況を報告しました。本日も盛況でした！(12/3)
- 第43回日本分子生物学会年会 MBSJ2020 Online が始まりました！初日は水谷さんがワークショップで発表し、金岡さん、荻田さん、牟禮さん、林さんがポスター発表しました。上村さんは終日「みやこめっせ」に設営された基地局／本部につめてました。のべ4,171人が参加されました！(12/2）
- 科学新聞に第43回日本分子生物学会年会 MBSJ2020 Online の特集記事（4-6面）が掲載されました ( https://sci-news.co.jp/admin/wp-content/uploads/2020/11/sci-news20201127-bunseigakukai.pdf)。年会長の上村さんがインタビューに答えています。(11/27)
- 上村さんが、千里ライフサイエンス新適塾「脳はおもしろい」第30回会合で講演しました。タイトルは「モデル動物と非モデル動物との対比による栄養バランスへの適応機構の解析」でした。この機会をくださいました山本亘彦先生（阪大生命機能）、古川貴久先生（阪大蛋白研）、千里ライフサイエンス振興財団に厚く御礼申し上げます。（9/28）
- MBSJ2020 Online に上村研からは計７演題が登録されました。（9/15）
- 和多田さん（愛媛大学）と、林さん、渡辺さん、水谷さん、牟禮さん、服部さんが共同した研究の論文が、Genes to Cells から発表されました。タイトルは “Divergence of Drosophila species: longevity and reproduction under different nutrient balances” です。(9/14)
- 秋の訪れと共に、坪井さん（8/31）、林さん＋上村さん（9/7）、荻田さん（9/14）とプログレスレポートが続いています。これからもガンガン続きます。
- 上村さんの MBSJ2020 Online 年会長としての記事が、生物科学学会連合HPのリレーエッセイ「新しい学術集会の形」に掲載されました。（8/17）
新しい学術集会の形を目指して 〜学会の挑戦〜 第三回 日本分子生物学会編
- 上村さんが年会長を務める MBSJ2020 Online の演題登録と事前参加登録が始まりました！ぜひご登録ください。（8/7）
- 服部さんが、京都大学男女共同参画推進センターの News Letter 「たちばな」の「連載：研究者になる！第78回」に登場しました（7/15）。
- 最新の研究内容と担当する先生方を、動画で見れるようにしました！「研究内容」のページから見てください(6/26）。
- 司さんが帝人久村奨学生に採用されました！おめでとうございます(6/26）。
- 和多田さん（愛媛大学）と、林さん、渡辺さん、水谷さん、牟禮さん、服部さんが共同した研究の論文が、Genes to Cells に受理されました！タイトルは "Divergence of Drosophila species: longevity and reproduction under different nutrient balances" です。(6/19)
- 司さんがオンラインジャーナルクラブを担当しました。取り上げた論文は "The gut-brain axis mediates sugar preference" です (6/8)。
- 服部さんが、公益財団法人 日本応用酵素協会の「成人病の病因・病態の解明に関する研究助成」に採択されました!（6/5）
- 坂口さんがオンラインジャーナルクラブを担当しました。取り上げた論文は "Quantitative Analysis of 3D Tissue Deformation Reveals Key Cellular Mechanism Associated with Initial Heart Looping" です (5/18)。
- オンラインラボミーティングを開始しました。トップバッターは、牟禮さんが担当するジャーナルクラブでした。取り上げた論文は "Host-Microbe-Drug-Nutrient Screen Identifies Bacterial Effectors of Metformin Therapy" でした（4/27） 。ラボミーティングに加えて、Diet group、Neuroscience group、Morphogenesis group それぞれのミーティングが、一斉にオンライン化されました。
- 春本さんのグループに早野（浅井）あづささんが参加しました。京都大学理学研究科生物科学専攻動物学教室のご出身です。（4/16）
- 津山泰一さんが日本学術振興会特別研究員PDに採用され、京都産業大学で研究を開始されました。新天地での一層のご活躍をお祈り申し上げます！（4/1）
- メンバーリストを新年度（令和２年度）用に新しくしました。日本学術振興会特別研究員（DC）が３名誕生しました！（4/1）
- 京都大学白眉センターのホームページに春本さんのページがオープンしました。研究課題は「性を操る微生物に学ぶ：昆虫の共生細菌による生殖操作を包括的に理解し応用する」です。（3/20）
https://www.hakubi.kyoto-u.ac.jp/mem/mem-10/member-10-10
- たちばな賞の授賞式がとり行われました。【研究者部門】において、上村研卒業生の杉村薫さん（iCeMS 特定拠点准教授）が受賞しました。服部さんは奨励賞を受賞しました。おめでとうございます！多数の関係者が出席下さったおかげで、今ままでで最も賑やかな表彰式とのことでした。写真を上村研写真集に掲載しました（3/3）。
- 第4回KBMSS (京都生体質量分析研究会) が開催され、上村研のメンバーがお手伝いをしました。渡辺さん、金岡さん、牟禮さん、水谷さんがポスター発表をして、多数の先生方にご議論頂きました。実行委員長を務められた石川冬木先生と研究室の皆様、レクチャーして下さった原英二先生（大阪大学）、有田正規 先生、櫻井望先生（いずれも遺伝研DDBJ）、高橋春弥先生（農学研究科）ありがとうございました。情報交換会の写真を上村研写真集に掲載しています（2/19）。
- 卒業生の小野寺孝興さん（現University of North Carolina at Chapel Hill）が、第36回井上研究奨励賞授賞式出席のため一時帰国され、上村研を訪ねてくれました。写真を上村研写真集に掲載しました（2/6）。
- 服部さんが、第１２回京都大学優秀女性研究者賞の【研究者部門】において、奨励賞を受賞しました。上村研卒業生の杉村薫さん（iCeMS 特定拠点准教授）は、たちばな賞を受賞されました。皆様、おめでとうございます！（2/5）
- 鳥井孝太郎さん（荒木研）の学位公聴会が開催され、上村さんが調査員の一人を務めました。鳥井さんと丁々発止の議論を展開しました。写真を上村研写真集に掲載しました（2/3）。
- 新年会／修士論文作成ご苦労さん会／上村さん還暦祝いを開催しました。現在の研究室メンバーから、気持ちのこもったお祝いが上村さんに贈呈されました。これとは別に、研究室出身者の有志の方々から上村さんにお祝いが届いています。いずれも、上村さんはただただ感動です。写真を上村研写真集に掲載しました（1/31）。
- 生命科学研究科附属生命動態研究センターのリトリートが開催され、春本さんと上村さんが発表しました。Kaiさんと金岡さんがポスター発表しました。写真を上村研写真集に掲載しました（1/25-26）。
- 渡辺さんと服部さんが、実験医学2月号のカレントトピックスに論文紹介記事を書きました。タイトルは「種間の栄養環境への適応能力の差を生む炭水化物応答機構」です。(1/22)
https://www.yodosha.co.jp/jikkenigaku/book/9784758125284/index.html
- 上村さんが年会長を務める第43回日本分子生物学会年会 (MBSJ2020) のホームページが開設されています！
https://www2.aeplan.co.jp/mbsj2020
英語版もあります。ぜひ訪ねてみて下さい。